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🔬 剪接因子 PABPC4 靶基因疾病富集分析
| 疾病名称 | Overlap | P-value | 富集倍数 | 相关靶基因 |
|---|---|---|---|---|
| dengue disease | 81/212 | 0.001008 | 1.28x | CHERP, SRSF3, HNRNPF, SF3A1, SRRM1, RBM22, RBMX, PRPF19, SNRPE, PPIE, HNRNPK, SRSF1, NUDT21, SNRNP40, HNRNPA1, U2AF1, RBM17, ALYREF, SNRPF, SF3B1 |
| neurodegenerative disease | 140/422 | 0.008123 | 1.11x | SNRNP25, CHERP, SRSF3, MATR3, HNRNPF, SART3, SF3A1, HTATSF1, RBM39, RBM4, SRRM1, ZCRB1, RBM22, RBM27, RBMX, DDX6, PRPF19, ZRANB2, SNRPE, TRA2A |
| hepatocellular carcinoma | 43/113 | 0.026513 | 1.27x | NONO, SF3B4, YBX1, HNRNPA2B1, SRSF3, AGO2, RBM15, TARDBP, DDX5, KHDRBS1, PABPC1, FUBP1, SF3B1, QKI, SPEN, HNRNPC, HNRNPD, PPIH, PTBP1, CPSF3 |
| salivary gland adenoid cystic carcinoma | 12/24 | 0.028501 | 1.67x | NONO, FUBP1, DDX6, DDX3X, HNRNPA2B1, NUMA1, SF3B1, SFPQ, SPEN, SND1, U2AF1, DDX5 |
💡 说明:
• Overlap: 靶基因中与该疾病相关的基因数 / 数据库中该疾病总关联基因数
• P-value: 超几何检验显著性,越小代表富集越显著
• 富集倍数: 实际关联数 / 期望关联数,>1 表示富集
• Overlap: 靶基因中与该疾病相关的基因数 / 数据库中该疾病总关联基因数
• P-value: 超几何检验显著性,越小代表富集越显著
• 富集倍数: 实际关联数 / 期望关联数,>1 表示富集