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🔬 剪接因子 PABPC4 靶基因疾病富集分析
| 疾病名称 | Overlap | P-value | 富集倍数 | 相关靶基因 |
|---|---|---|---|---|
| dengue disease | 81/212 | 0.001008 | 1.28x | FUS, SF3B1, NUDT21, SRSF1, HNRNPA3, RBM22, HNRNPK, RBM17, PPIE, PRPF19, PABPC1, SRSF6, HNRNPC, PHF5A, SRSF7, HNRNPA0, XAB2, DDX5, HNRNPD, DDX3X |
| neurodegenerative disease | 140/422 | 0.008123 | 1.11x | SF3B1, SRSF1, RBM38, SAMD4B, RBM22, HNRNPK, PRPF38A, MAGOH, RBM17, PRPF19, DDX17, PABPC1, MBNL1, LSM6, LUC7L3, SART3, EIF4B, LSM4, SNRNP70, HNRNPC |
| hepatocellular carcinoma | 43/113 | 0.026513 | 1.27x | FUS, SF3B1, SRSF1, THRAP3, KHDRBS1, SFPQ, HNRNPK, PCBP1, SF3B4, PRPF19, DDX17, PABPC1, SRSF10, ELAVL1, EWSR1, ADAR, PPIH, HNRNPA2B1, UPF1, HSPA8 |
| salivary gland adenoid cystic carcinoma | 12/24 | 0.028501 | 1.67x | NUMA1, SF3B1, FUBP1, DDX5, SPEN, SFPQ, U2AF1, HNRNPA2B1, NONO, DDX6, DDX3X, SND1 |
💡 说明:
• Overlap: 靶基因中与该疾病相关的基因数 / 数据库中该疾病总关联基因数
• P-value: 超几何检验显著性,越小代表富集越显著
• 富集倍数: 实际关联数 / 期望关联数,>1 表示富集
• Overlap: 靶基因中与该疾病相关的基因数 / 数据库中该疾病总关联基因数
• P-value: 超几何检验显著性,越小代表富集越显著
• 富集倍数: 实际关联数 / 期望关联数,>1 表示富集